博德研究所、英特爾、谷歌聯(lián)手推進(jìn)生物醫(yī)學(xué)研究
借助谷歌在工程和英特爾在優(yōu)化方面的優(yōu)勢(shì)，博德研究所得以將研究水平提升到新的高度
為加快基因組研究，隸屬于麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)的博德研究所與英特爾和谷歌云攜手合作，優(yōu)化了他們的工作流，以獲得快速、經(jīng)濟(jì)的谷歌N1和N2實(shí)例。與最初部署在谷歌云上的工作負(fù)載相比，此次合作使優(yōu)化后的數(shù)據(jù)處理成本降低了85% (1)。
HPC基因組學(xué)圖像，由麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)博德研究所提供
麻省理工學(xué)院-哈佛大學(xué)博德研究所數(shù)據(jù)科學(xué)平臺(tái)外聯(lián)與傳播總監(jiān)Geraldine Van der Auwera 表示：“我們知道，云技術(shù)將使數(shù)據(jù)聯(lián)合和協(xié)作達(dá)到一個(gè)全新的水平。我們可以與其它各方合作，創(chuàng)建一個(gè)基于云的數(shù)據(jù)生態(tài)系統(tǒng)，使科研人員可以在利用自己生成的數(shù)據(jù)的同時(shí)，整合其它數(shù)據(jù)集，來實(shí)現(xiàn)更豐富、更強(qiáng)大的計(jì)算實(shí)驗(yàn)。”
為適應(yīng)基因組數(shù)據(jù)量和計(jì)算研究需求的急劇增長，博德研究所將其負(fù)載遷移到了谷歌云N2實(shí)例。在遷移到基于英特爾?至強(qiáng)?可擴(kuò)展處理器的N2實(shí)例上之后，通過對(duì)管線部署工作流進(jìn)行模塊化處理、根據(jù)負(fù)載需求正確調(diào)整云實(shí)例的大小并針對(duì)至強(qiáng)可擴(kuò)展處理器進(jìn)行優(yōu)化，博德研究所的用戶可以將其基因組學(xué)工作流在谷歌云上的運(yùn)行速度提高約25%、成本降低34%(1)。
英特爾與博德研究所自2017年起便展開合作，利用英特爾函數(shù)庫（包括英特爾?基因組學(xué)核心函數(shù)庫）幫助該研究所優(yōu)化其管線部署和基因組分析工具包。雙方還共同管理英特爾-博德基因組數(shù)據(jù)工程中心，來幫助世界各地的研究人員和軟件工程師構(gòu)建、優(yōu)化并廣泛共享新的工具和基礎(chǔ)設(shè)施，以及幫助科學(xué)家整合和處理基因組數(shù)據(jù)。
英特爾還與博德研究所合作，幫助優(yōu)化其在谷歌云上的管線部署。例如，基因組分析工具包中的特定內(nèi)核針對(duì)使用英特爾?高級(jí)矢量擴(kuò)展指令集512（英特爾? AVX-512）的矢量運(yùn)算進(jìn)行了優(yōu)化。一些優(yōu)化的存儲(chǔ)功能使用了英特爾?智能存儲(chǔ)加速函數(shù)庫（英特爾? ISA-L）。
為了實(shí)現(xiàn)更廣泛的生命科學(xué)生態(tài)系統(tǒng)愿景，博德研究所、微軟和Verily共同開發(fā)了Terra平臺(tái)。這是一個(gè)安全的可擴(kuò)展平臺(tái)，供全球生物醫(yī)學(xué)研究人員訪問數(shù)據(jù)、運(yùn)行分析工具并進(jìn)行協(xié)作。Terra是在云基礎(chǔ)架構(gòu)之上構(gòu)建的，這使博德研究所能夠輕松擴(kuò)展，并為科研人員提供新功能，使其更好地研究攻克人類疾病的解決方案。
基因組學(xué)已經(jīng)改變了生物科學(xué)的呈現(xiàn)方式。在英特爾和谷歌云的幫助下，博德研究所處于創(chuàng)新前沿，支持并幫助加速基因組學(xué)的研究進(jìn)程。通過遷移到云并針對(duì)谷歌云實(shí)例對(duì)負(fù)載進(jìn)行優(yōu)化，博德研究所以一種可擴(kuò)展、前瞻性的方式完成了存儲(chǔ)容量和計(jì)算能力方面的挑戰(zhàn)。共同構(gòu)建Terra平臺(tái)使博德研究所不僅賦能其研究團(tuán)隊(duì)，而且還賦能世界各地的生命科學(xué)家，使他們能夠充分利用這些優(yōu)化的工具和管線部署，來創(chuàng)造一個(gè)聯(lián)合數(shù)據(jù)生態(tài)系統(tǒng)，為生物醫(yī)學(xué)研究開啟諸多激動(dòng)人心的全新可能性。
免責(zé)聲明
性能因用途、配置和其他因素而異。
英特爾技術(shù)可能需要支持的硬件、軟件或服務(wù)激活。?英特爾公司版權(quán)所有。英特爾、英特爾標(biāo)識(shí)以及其他英特爾商標(biāo)是英特爾公司或其子公司在美國和/或其他國家的商標(biāo)。文中涉及的其它名稱及品牌屬于各自所有者資產(chǎn)。
關(guān)于英特爾
英特爾作為行業(yè)引領(lǐng)者，創(chuàng)造改變世界的技術(shù)，推動(dòng)全球進(jìn)步并讓生活豐富多彩。在摩爾定律的啟迪下，我們不斷致力于推進(jìn)半導(dǎo)體設(shè)計(jì)與制造，幫助我們的客戶應(yīng)對(duì)最重大的挑戰(zhàn)。通過將智能融入云、網(wǎng)絡(luò)、邊緣和各種計(jì)算設(shè)備，我們釋放數(shù)據(jù)潛能，助力商業(yè)和社會(huì)變得更美好。
?英特爾公司，英特爾、英特爾logo及其它英特爾標(biāo)識(shí)，是英特爾公司或其分支機(jī)構(gòu)的商標(biāo)。
*文中涉及的其它名稱及品牌屬于各自所有者資產(chǎn)。
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